Hợp tác nghiên cứu genome của 201 loài vi khuẩn

 Hợp tác nghiên cứu genome của 201 loài vi khuẩn

Các nhà khoa học Hoa Kỳ đã giải trình tự thành công genome của 201 microbes để tìm ra nhiều hơn các hiểu biết về vai trò của sinh vật đơn bào trong môi trường sống. Dự án nghiên cứu này do DOE-JGI (U.S. Department of Energy-Joint Genome Institute) thực hiện, bao gồm nội dung giải mã trình tự di truyền của sinh vật mà cuộc sống chưa được khám phá, với thuật ngữ "microbial dark matter" (thể vi khuẩn sống trong bóng tối) từ chín habitats vô cùng đa dạng: Hồ Sakinaw ở British Columbia; Vịnh hồ Etoliko ở Western Greece; lò phản ứng dầu cặn ở Mexico; Vịnh Maine; bờ biển phía Bắc Oahu, ở Hawaii, vùng Tropical Gyre tại Nam Đại tây Dương; vùng East Pacific Rise; vùng mỏ Homestake Mine tại South Dakota; và vùng Great Boiling Spring ở Nevada. Từ các mẫu thu thập ấy, nhóm nghiên cứu đã xếp nhóm nhờ tia laser với 9 nghìn tế bào (laser-sorted), từ đây, học có thể ráp lại và xác định 201 genome khác biệt nhau, rồi so sánh chuỗi trình tự 28 nhánh chính chưa ghi trên giản đồ nào trước đây  trong sơ đồ cây gia hệ. Một phát hiện thứ hai của công trình này là làm chính xác sự sắp xếp, hoặc cung cấp dữ liệu 340 triệu đoạn phân tử DNA từ những habitats khác đối với nòi nào đó (proper lineage). Sự hiệu đính này cho thấy làm thế nào các sinh vật thể hiện chức năng trong một hệ sinh thái hết sức đặc biệt. Kết quả thứ ba của nghiên cứu này là tìm ra giải pháp đối với mối quan hệ giữa và trong microbial phyla – phân loại giữa domain và class – từ đ1o, nhóm nghiên cứu đã đề xuất hai superphyla  mới. Tanja Woyke, Trưởng nhóm DOE-JGI Microbial Program nói rằng "Các vi khuẩn có quần thể phong phú nhất và đa dạng nhất trong cuộc sống của thế giới này. Các hiểu biết của chúng ta về nơi cư ngụ của chúng (habits) và tiềm năng sinh lợi của chúng đã và đang gây trở ngại bởi sự kiện mà chúng ta ít có thể nuôi cây chúng trong điều kiện phòng thí nghiệm. Cái mà chúng ta vừa khám phá vẫn chưa mở ra kỳ vọng về bản chất biến dưỡng mà việc hiểu biết chúng vẫn còn là thách thức trong sinh học cuộc sống." Xem tạp chí Nature http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature12352.html. Hoặc http://www.jgi.doe.gov/News/news_13_07_14.html.